संपूर्ण रोगाणु की बजाए रोगाणु के हानिरहित भाग (प्रोटीन) शामिल होते हैं। टीकाकरण होने के बाद, हमारा शरीर यह पहचान करता है कि प्रोटीन को वहाँ नहीं होना चाहिए और टी-लिम्फोसाइट्स तथा एंटीबॉडीज़ (रोग-प्रतिकारक) कहे जाने वाले रक्त अंशों का निर्माण करता है जो भविष्य में हमारे रोगाणु की चपेट में आने की स्थिति में यह याद रखेगा कि रोगाणु से कैसे जूझना है।
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